代谢组学数据分析及多元统计分析与应用
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单细胞质谱分析
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蛋白全谱鉴定
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采用艾德曼降解法的N端测序:优势、局限与改进措施
N端测序是蛋白质组学研究的技术之一,其中艾德曼降解法(Edman Degradation)长期以来被认为是测定蛋白或多肽N端序列的经典方法。该方法基于苯硫酰异氰酸酯(PITC)对N端氨基酸的选择性标记,并通过逐步降解实现氨基酸序列的解析。尽管近年来基于质谱的测序技术迅速发展,但艾德曼降解法仍在某些特
蛋白全长测序:高精度、低样本量的完整序列覆盖方案
在生命科学研究与生物医药开发中,蛋白质的结构与功能密切相关,而蛋白的全长序列信息则是解析其功能、突变位点修饰及翻译后加工等过程的关键数据基础。传统质谱方法往往依赖酶解将蛋白“打碎”成肽段进行识别,可能导致序列信息缺失。蛋白全长测序(Full-Length Protein Se
MRM靶向定量蛋白质组学用于评估PROTAC效力
一、PROTAC:从“抑制”到“降解”的药物新范式 与传统小分子抑制剂不同,PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera,蛋白降解靶向嵌合体)通过招募E3泛素连接酶,实现对靶标蛋白的泛素化并诱导其在细胞内被蛋白酶体降解。这种
避免数据不准确:通过这些非变性质谱分析技巧优化结果
非变性质谱分析(Native Mass Spectrometry, Native MS)是一种能够在接近生理条件下研究蛋白质及其复合物的强大技术,广泛应用于蛋白质组学、结构生物学和药物研发。然而,由于蛋白复合物的复杂性、离子化过程的不稳定性及实验条件的多变性,非变性质谱分析的数据往往存在不准确或难以
基于质谱的N端测序分析:复杂样本中的挑战与解决方案
N端测序分析能够揭示蛋白质的起始端序列,从而为理解蛋白质的功能、结构以及相互作用提供关键信息。近年来,随着质谱技术的进步,基于质谱的N端测序在蛋白质组学领域得到了广泛应用。然而,在复杂生物样本中,进行N端序列的分析仍然面临诸多挑战。下面我们将深入探讨这些挑战,并提出相应的解决方案建议。 1、复杂样
C端测序 vs N端测序:技术难点与应用场景全解析
C端测序和N端测序是蛋白质分析中解析蛋白末端氨基酸序列的关键技术。由于蛋白C端和N端的化学特性、修饰方式及稳定性存在显著差异,这两种测序技术在方法选择、技术难点及适用场景上各具特色。本文将对比C端测序与N端测序的核心技术,解析其主要难点,并探讨它们在不同研究领域的应用场景。 一、技术原理概述 1、
C端测序:避免LC-MS/MS分析中的8大常见错误
蛋白质组学中的LC-MS/MS分析(液相色谱-串联质谱)广泛应用于蛋白质鉴定、修饰研究和定量分析。然而,在C端测序(C-terminal sequencing)过程中,许多研究人员可能会在实验设计、数据采集和数据分析等方面犯下一些常见错误,影响最终的研究质量和结论的可靠性。本文将总结LC-MS/MS